Specializace
Složení a funkce společenstev půdních mikroorganismů v disturbovaných lesních ekosystémech
- vliv atmosférických depozic - acidifikace a dusíková zátěž
- vliv odumření lesa po kůrovcovém žíru
Stručný životopis
Vzdělání:
- 1998 - 2006 Gymnázium Písek
- 2006 - 2009 Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v ČB - Bc. obor Péče o životní prostředí, specializace krajina
- 2009 - 2012 Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v ČB - Mgr. obor Ekologie, specializace aplikovaná ekologie
- 2012 - 2020 Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v ČB - Ph.D. obor Biologie ekosystémů
Zaměstnání:
- 2012 - současnost Katedra biologie ekosystémů PřF JU - vědecký pracovník a přednášející (od 2019)
Další informace
Přednášející:
- KBE/552 Ekologie půdních organismů pro PŽP
- KBE/053 Environmentální DNA
Cvičící:
- KBE/521 Ekologie půdy
- KBE/260 Mikrobiologie
- KBE/760 Biology of Microorganisms
Granty:
člen týmu
- GA20-19471S – GeoMicLink: Microbial imprint in catchment scale nutrient retention
- GA20-19284S – Phosphorus leaching from undeveloped alpine soils: Biotic or abiotic control?
- GA20-14704Y – Integrating experimental and modelling approach to understand the effect of redox potential on microbial carbon use efficiency
- GA19-16605S – An interdisciplinary study on element cycling in mountain catchment-lake systems regenerating from tree dieback
- GA18-19561S – Decay resistance of Sphagnum – biochemical causes and consequences
- P504-17-15229S – Phosphorus dynamics in unmanaged terrestrial ecosystems: Links with nitrogen and carbon cycling.
jiná účast
- P503-14-09231S – An integrated study on effects of changing environmental chemistry and climate on biogeochemical processes in soils (weathering, mineralization, P and Al mobility) and lakes (nutrient availability, toxicity) and their biodiversity (soil and water invertebrates).
- P504/12/1218 – The effect of natural dieback of mountain spruce forest on microclimate, chemistry, and biodiversity of terrestrial and aquatic ecosystems.
Publikace:
Choma, M., Šamonil, P., Kaštovská, E., Bárta, J., Tahovská, K., Valtera, M., & Šantrůčková, H. (2021). Soil Microbiome Composition along the Natural Norway Spruce Forest Life Cycle. Forests, 12(4), 410. https://doi.org/https://doi.org/10.3390/f12040410
Čapek, P., Choma, M., Tahovská, K., Kaňa, J., Kopáček, J., & Šantrůčková, H. (2021). Coupling the resource stoichiometry and microbial biomass turnover to predict nutrient mineralization and immobilization in soil. Geoderma, 385, 114884.
Choma, M., Tahovská, K., Kaštovská, E., Bárta, J., Růžek, M., & Oulehle, F., 2020. Bacteria but not fungi respond to soil acidification rapidly and consistently in both a spruce and beech forest. FEMS Microbiology Ecology, 96(10).
Tahovská K., Choma M., Kaštovská E., Oulehle F., Bárta J., Moldan F., 2020. Positive response of soil microbes to long-term nitrogen input in spruce forest: Results from Gårdsjön whole-catchment N-addition experiment, Soil Biology and Biochemistry 143: 107732.
Choma M., Rappe-George M.O., Bárta J., Čapek P., Kaštovská E., Gärdenäs A.I., Šantrůčková H. 2017. Recovery of the ectomycorrhizal community after termination of long-term nitrogen fertilisation of a boreal Norway spruce forest. Fungal Ecology 29: 116–122.
Rappe-George M.O., Choma M., Čapek P., Börjesson G., Kaštovská E., Šantrůčková H., Gärdenäs A.I. 2017. Indications that long-term nitrogen loading limits carbon resources for soil microbes. Soil Biology and Biochemistry 115: 310–321.
Kotas P., Choma M., Šantrůčková H., Lepš J., Tříska J., Kaštovská E. 2017. Linking above- and belowground responses to 16 years of fertilization, mowing, and removal of the dominant species in a temperate grassland. Ecosystems 20(2): 354–367.
Choma M., Bárta J., Šantrůčková H., Urich T. 2016. Low abundance of Archaeorhizomycetes among fungi in soil metatranscriptomes. Scientific Reports 6: 38455.