Dlouhodobě spolupracujeme s následujícím institucemi:
- Biologické centrum Akademie věd ČR, především Ústav půdní biologie a Hydrobiologický ústav
- Ústav pro výzkum lesních ekosystémů (IFER)
- Zahraniční univerzity v Helsinkách, Hannoveru, Vídni a v Uppsale
