Specializace
Mikrobiální transformace uhlíku, dusíku a fosforu v půdě, využitelnost organického uhlíku půdními mikroorganismy, ekologická stechiometrie, využití přirozeného výskytu stabilních izotopů pro studium mikrobiálních procesů v půdě
Stručný životopis
Jsem profesorkou ekologie na PřF JU v Českých Budějovicích. Ukončila jsem magisterská studia na ČZU v Praze a doktorská studia na Mikrobiologickém ústavu v Praze. Ve svém výzkumu mikrobiální transformace uhlíku, dusíku a fosforu jsem pokračovala na Ústavu půdní biologie v Českých Budějovicích a ve výzkumu transformace organického uhlíku v půdě pomocí metod přirozeného výskytu stabilních izotopů na ANU (Australian National University).
Vzdělání:
2005 Profesor – Ekologie, Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
2000 Docent – Ekologie, Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
1988 PhD. - Ekologie, specializace Microbiologie (Československá akademie věd, Profesor V. Vančura and Profesorka M. Tesařová)
1979 Ing. (MSc.) – Česká zemědělská univerzita v Praze (rostlinná produkce)
Vědecká činnost:
2007 - Přírodovědecká fakuklta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (od 2013 vedoucí katedry Biologie ekosystémů, od 2019 děkanka Přírodovědecké fakulty)
2016 - 2018 Soil & Water Research Infrastructure (SoWa), Biologické centrum Akademie věd České republiky
2000 - 2007 Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích - vedoucí katedry Ekologie a hydrobiologie
1997 - 2000 Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích - přednášející
Ústav půdní biologie Akademie věd České republiky – výzkumný pracovník
1994 – 1997 Australian National University, Canberra, Australia, visiting fellow
1989 - 1994 Ústav půdní biologie – výzkumný pracovník
1981 – 1989 Postdoktorské studium, Ústav půdní biologie Akademie věd České republiky, České Budějovice, (including parental leave from 1982 to 1986)
1980 - 1981 Laboratoř půdní biologie, Ústav krajinné ekologie Akademie věd České republiky, České Budějovice
1979 – 1980 Oddělení mikrobiální ekologie, Mikrobiologický ústav Akademie věd České republiky, Praha
Další informace
Professional Activities & Responsibilities:
• Principal investigator (PI) in the project of the Commission of EC (CROPCHANGE, EV5V CT92-0169) (1993- 1995)
• visiting fellow in the Group of Environmental Biology RSBS ANU, Canberra, Australia (1995-1996)
• visiting fellow in the Group of Organic Geochemistry RSES ANU, Canberra, Australia (1996-1997)
• visiting professor at SLU, Uppsala (August 2013 – December 2013)
• BOBCAT (“Boat on a Boreal Carbon Tour”) campaign to Central Siberia jointly undertaken by the Max Planck Institute for Biogeochemistry (Jena, Germany) and the Institute of Forest (Krasnoyarsk, Russia, 1998)
• subcontractor in the EU project EMERGE (EVK1-CT-1999-00032) - data specialist for soil chemistry and biology
• PI of EU project TCOS-Siberia (EVK2-2002-00555) – in the frame of NAS call (2002 - 2005)
• bilateral collaboration with University of Davis, California supported by NSF and Czech Ministry of Education (2007-2009)
• PI of CryoCarb project awarded by ESF in the frame of Polar Climate Call (2011-2013)
• National projects awarded from 2006: Coordinator of 1 project (Ministry of Youth, Sport and Education, 2006-2012), co-PI of five projects (Grant Agency of the Czech Republic)
• president of Czech Society for Ecology (2007-2012)
• program director of MSc. and Ph.D. specializations of Ecosystem Biology/Ecology
• member of the senate of the Faculty of Science USB (from 2016-2018 chairman)
• president of Ethical Committee of the USB
• reviewer of ISI-listed scientific journals
Areas of Competence:
Current research and interests include: (i) carbon sequestration and mineralization in arctic and boreal forest soils (ii) carbon (C), nitrogen (N) and phosphorus (P) transformations in forest soils (iii) link between C, N and P cycling in soil – decomposer biomass stoichiometry, extracellular enzymes production (iv) effect of acidification, eutrophication and forest management on soil biochemistry (v) link between soil processes and vegetation cover in various ecosystems.
Teaching Activities (some courses are not opened each year):
• Stable Isotopes in Environmental Sciences, Ecology and Physiology (http://www.wzw.tum.de/isotopeschool/index.htm, from 2003-)
• Stable isotopes in Biology (University of Vienna, 2007-2008)
• Carbon in agricultural and forest soils (University of Helsinki, 2011)
• Biogeochemical cycles (USB in České Budějovice, in Czech from 2006)
• Biogeochemistry (USB in České Budějovice, in Czech from 2017-)
• Soil Ecology (USB in České Budějovice, in Czech from 1998-, in English from 2016-)
• Soil microbiology (USB in České Budějovice, in Czech, from 2002-2016)
• Global biogeochemical cycles (Charles Univ. in Prague, in Czech 2011-2016)
• supervisor of Bc, M.Sc. and Ph.D. theses
Publication record (ORCID):
WOS - 2913 citations without self-citations, 126 publications in impacted journals, 4 chapters in books
h-index = 31
List of 10 most important publications 2015-2019:
1. Šantrůčková, H., Cienciala, E., Kaňa, J., & Kopáček, J. 2019. The chemical composition of forest soils and their degree of acidity in Central Europe. Science of The Total Environment, 687, 96-103. IF 5.58
2. Šantrůčková H., Kotas P., Bárta J., Urich T., Čapek P., Palmtag J. et al. (2018) Significance of dark CO2 fixation in arctic soils. Soil Biology and Biochemistry 119, 11- 21. IF 4.93
3. Čapek, P.T. Manzoni, S., Kaštovská, E., Wild, B., Diákova, K., Bárta, J., Schnecker, J., Blasi, C., Martikainen, P.J., Alves, R.J.E., Guggenberger, G., Gentsch, N., Hugelius, G., Palmtag J., Mikutta, R., Shibistova, O., Urich, T., Schleper, C., Richter, A., Šantrůčková H. (2018) A plant–microbe interaction framework explaining nutrient effects on primary production. Nature Ecology & Evolution, 1588. IF 10.97
4. Manzoni S., Čapek P., Mooshammer M., Lindahl B.D., Richter A. and Šantrůčková H. (2017) Optimal metabolic regulation along resource stoichiometry gradients. Ecology Letters 20, 1182-1191. IF 9.14
5. Kaštovská, E., Edwards, K., Šantrůčková, H. (2017) Rhizodeposition flux of competitive versus conservative graminoid: contribution of exudates and root lysates as affected by N loading. Plant and Soil, 412, 331-344. IF 3.31
6. Čapek P., Kotas P., Manzoni S., Šantrůčková H. (2016) Drivers of phosphorus limitation across soil microbial communities. Funct Ecol 30, 1705–1713. IF 5.49
7. Schädel, C., Bader, M. K. F., Schuur, E. A., Biasi, C., Bracho, R., Čapek, P., De Baets, S., Diáková K., Ernakovich, J., Estop-Aragones, C., Graham, D.E., Hartley, I.P., Iversen, C.M., Kane, E., Knoblauch, C. Lupascu, M., Martikainen,P.J., Natali, S.M., Norby, R.J., O’Donnell, J.A., Chowdhury, T.R., Šantrůčková, H., Shaver, G., Sloan, V.L., Treat, C.C., Turetsky, M.R., Waldrop, M.P., Wickland K.P., (2016). Potential carbon emissions dominated by carbon dioxide from thawed permafrost soils. Nature Climate Change. 6, 950-953. IF 19.18
8. Čapek P., Diáková K., Dickopp J.-E., Bárta J., Wild B., Schnecker J., Alves R.J.E., Aiglsdorfer S., Guggenberger G., Gentsch N., Hugelius G., Lashchinsky N., Gittel A., Schleper C., Mikutta R., Palmtag J., Shibistova O., Urich T., Richter A., Šantrůčková H. (2015) The effect of warming on the vulnerability of subducted organic carbon in arctic soils. Soil Biology & Biochemistry 90, 19-29. IF 4.41
9. Kaňa J., Tahovská K., Kopáček J., Šantrůčková H. (2015) Excess of organic carbon in mountain spruce forest soils after bark beetle outbreak altered microbial N
transformations and mitigated N-saturation. PLoS ONE 10: e0134165. IF 3.23
10. Kaštovská E., Edwards K., Picek T., Šantrůčková H. (2015) A larger investment into exudation by competitive versus conservative plants is connected to more coupled plant-microbe N cycling. Biogeochemistry 122, 47-59. IF 3.73